反滲透設備中使用的脫鹽工藝是將水中的二氧化碳轉化成碳酸氫鹽。當OH-增加時，該反應就向左進行。當水OH值大于8.2時，水中的CO2將轉化為HCO3-。

在反滲透設備脫鹽過程中，有一個添加堿的步驟，反滲透膜的結垢傾向會變大，因為LSI值遠高于允許范圍。實踐證明，在加堿前采用反滲透系統，不采取其它措施，反滲透濃水的結晶會沉淀，在濃水側可在1～2小時內發現白色結晶。因此，在RO之前加入阻垢劑以減少結垢仍然是很需要的。

不同的原水水質對反滲透設備的清洗周期有著不同的影響。適當的清洗可以恢復到正常狀態，但經過一段時間后，它又會出現。反滲透系統的堿和阻垢劑的分析與原水水質中有機質含量的變化有關。在更換了另一種阻垢劑后，問題就會得到解決。

如果原水使用的是硬度較高的深井水，由于在RO系統前添加堿液，雖然添加了阻垢劑減少了系統結垢的時間，但是RO膜結垢的趨勢仍然比采用自來水作為原水來得要快。

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